疾控地带- 第7章 新发病例(1/2)

忙活了一早上，走出实验室已经是早晨七点多，刚好是早饭时间。

叶蓁蓁刚到g省疾控，很多地方不熟悉，王亚楠很热心地带着叶蓁蓁去了中心食堂，一起吃过早饭，王亚楠叹道：“我们平时最怕遇到紧急疫情，每次遇到都要加班，这次还好，样品是早晨五点送到的，以前经常是凌晨一两点，忙活完，一整晚都不用睡觉了，你们国家cdc也经常这样吧？”

叶蓁蓁想起之前儿童福利中心爆发的出血热疫情，当时就是整晚没睡地做实验，现在再听王亚楠的诉苦，感同身受地笑了笑，“嗯，一样啊。”

想起这次来g省的任务，叶蓁蓁主动要求说：“从百子村死者标本分离出来的炭疽杆菌，你们做了序列分析吧？”

“嗯，昨天刚做了初步序列分析，叶老师，你想看结果？”

“是的，昨晚在报告会上，主讲人说过，这次分离出来的炭疽菌株跟b市之前流行的菌株，同源性很低，那跟这次菌株同源性最高的菌株是在哪个流行区分离出来的？”

王亚楠摇摇头，“昨天跟国内几个流行株做了初步比对分析，没有跟这次分离到的菌株同源性超过百分之九十的。”

“什么？同源性这么低！按照现在的数据，它都可以单列一个菌种了。”

“是啊，这就是这次疫情奇怪的地方，要不，我们g省疾控也不会向国家cdc求助了，刚才就算叶老师不提这件事，我也要带你去看昨天做出来的序列分析图呢。”

“好，现在就去。”

叶蓁蓁匆忙扒完碗里的饭，催促着王亚楠去实验室，每次遇到这种奇怪的实验现象，叶蓁蓁和南之乔的反应一样，激动又兴奋。

王亚楠带着叶蓁蓁去了实验楼的计算机房，所有需要进行序列分析，建立进化树，基因测序的后续工作都在计算机房完成。

g省疾控计算机房规模颇大，六七十平米的房间里放着八台电脑，西面还放着一排文件柜，柜子前是一排办公桌，很空旷的感觉。

计算机房里已经有两个人坐在电脑前，王亚楠带着叶蓁蓁走进机房，众人点点头算是打过招呼。

王亚楠在一台电脑坐下，打开电脑，随手拖过来一张旋转椅让叶蓁蓁坐在旁边。

叶蓁蓁坐在一旁，看着王亚楠从电脑中调出昨天做出的炭疽杆菌序列图，看了两眼，叶蓁蓁就发现了问题，一个单独的序列突出在众序列之外，序列后面用英文标注着毒株名称，baiziantis，叶蓁蓁指着电脑屏幕上单突出来的序列，问：“这就是从百子村死者身上分离出来的炭疽杆菌吧？”

“是的，下面这些是从国内各个炭疽流行区选出来的具有代表性的序列，对比分析后，从百子村新分离出来的这株炭疽杆菌因为与其他的同源性太低，所以系统软件将其单列出来一个分支。”周亚楠一边盯着电脑屏幕，一边用纳闷的口气说，“这就是这次炭疽疫情最奇怪的地方。”

叶蓁蓁心想，不会是新出现的变异株吧？每次细菌或病毒发生大的变异时，致病力都会发生相应的改变，这次百子村的祖孙四人发病急，症状严重，可能就是因为新出现的炭疽杆菌发生变异的缘故。

叶蓁蓁说出自己的想法，周亚楠点点头，解释说：“这个变异的可能，我之前也想过，所以打算今天对其中的几个毒力基因做一下分析。”

周亚楠开始调出各种炭疽杆菌的毒力基因，开始对比分析，边操作软件边说：“我们g省疾控用的这些序列分析软件还是南主任推荐的，分析方法也是之前去中国cdc统一培训过的，叶老师，这套分析软件和方法您也很熟悉吧？”

“嗯，这套分析软件是现在国际通用的，发表i论文的时候也认可这种方法。”

叶蓁蓁心想着，这套分析方法最初还是南之乔在巴黎的巴斯德研究所教会了自己，后来到了中国cdc南之乔的实验组，用的就更频繁了，每次做各种病毒的进化树，南之乔总是要求将国际上所有分离测序出来的代表毒株都放进进化树里，说是这样能全面分析，发现一些意想不到的东西……

想到这里，叶蓁蓁突然灵机一动，兴奋地对身旁的王亚楠说：“百子村分离出来的菌株，怎么没有跟国外其他地区的流行株做一下对比分析？”

王亚楠愣了一下，闷闷地解释：“这两年g省都没有发现炭疽疫情，这次突然来了几个病例，从发现到分离出菌株，再到测序，不过两天时间，我临时从genebank中下载了几条国内炭疽杆菌的序列，就匆匆做了比对……”

明白了，就是时间匆忙，还没来得及做的意思，叶蓁蓁终于找到能帮得上忙的地方了，“我来下载全球炭疽杆菌序列，做全序列对比分析，哪台电脑能用？”

“这两台都可以，可以上网下载序列，也安装了序列分析软件。”周亚楠指着身旁的两台电脑。

叶蓁蓁选了一台，开始干活，进入genebank先选择炭疽杆菌，再按地区开始下载。

刚下载了两条序列，寂静的计算机房里，突然一阵刺耳的手机铃声，叶蓁蓁被吓了一跳，回头一看，周亚楠已经接通手机。

听着手机里传来的消息，周亚楠脸色越来越沉重，几十秒之后，周亚楠一副紧急备战的状态，站起身，向叶蓁蓁说：“叶老师，又有一起疑似炭疽疫情，死了一家六口，今早刚被发现的，标本正在送来的路上，我先去实验室准备一下，这里